เรื่องราวของ “Ethan Hunt” ซึ่งเขามีภารกิจในการซื้อ แกนพลูโทเนียม ที่ถูกขโมยไป ซึ่งการซื้อขายครั้งนี้จะเกิดขึ้นในกรุงเบอร์ลินจาก แก๊งอันธพาลยุโรปตะวันออก โดยภารกิจนี้เขาได้พา “Benji Dunn” และ “Luther Stickell” มาร่วมภารกิจด้วย แต่ทุกอย่างได้ผิดแผนทันที ที่ “Stickell” ถูกจับตัวไป
การที่ “Hunt” พยายามช่วยเหลือลูกทีมของเขานั้นเปิดโอกาสให้นักค้าอาวุธ “Alanna Mitsopolis” หยิบเจ้าพลูโทเนียมไป ทำให้ “Hunt” ต้องกลับไปคิดวิธีการนำพลูโทเนียมกลับมาจากองค์กรที่ชื่อว่า ‘Apostles’ ก่อนที่โลกจะถูกปกคลุมไปด้วยสารกัมมาตาภาพรังสีจากนิวเคลียร์ที่ ‘Apostles’ จะปล่อยออกมา
