เรื่องราวของ “Ethan Hunt” ของหน่วย IMF ซึ่งเขาได้รับข้อความจาก ผู้เชี่ยวชาญด้านชีวเคมี ดร. “Vladimir Nekhorvich” ซึ่งเขาได้เตือนว่า พนักงานที่โรงงานยาชีวภาพ ได้สั่งให้เขาผลิตอาวุธชีวภาพเพื่อสร้างกำไรจากยารักษาที่พวกเขาคิดค้นขึ้น ซึ่งเขานัดกับ “Ethan” ไว้เพื่อส่งไวรัส ‘Chimera’ และยารักษา ‘Bellerophon’
ซึ่งในช่วงนี้ “Ethan” นั้นกำลังอยู่ในช่วงวันหยุด ทำให้ IMF ได้ส่ง “Sean Ambrose” ที่ปลอมตัวเป็น “Ethan” เพื่อไปหา “Nekhorvich” แต่ “Ambrose” ได้ทำการฆ่า “Nekhorvich” และขโมยยาพวกนั้นไป ทำให้ “Ethan” ต้องร่วมมือกับ “Nyah Nordoff-Hall” นักโจรกรรมมืออาชีพ เพื่อไปขโมยไวรัส ‘Chimera’ กลับคืนมาก่อนที่มันจะสายเกินไป
